Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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