Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL9A3Q14050 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A3Q14050 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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