Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF9Q13886 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms