Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms