Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDH18Q13634 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDH18Q13634 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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