Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CUL1Q13616 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL1Q13616 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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