Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTMR3Q13615 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR3Q13615 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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