Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

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Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAMK2BQ13554 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAMK2BQ13554 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
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