Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PICALMQ13492 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PICALMQ13492 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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