Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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MKRN4PQ13434 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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MKRN4PQ13434 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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MKRN4PQ13434 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN4PQ13434 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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