Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATMQ13315 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATMQ13315 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATMQ13315 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATMQ13315 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATMQ13315 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATMQ13315 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATMQ13315 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATMQ13315 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATMQ13315 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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