Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN3Q13286 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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