Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RIGQ13278 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RIGQ13278 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RIGQ13278 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RIGQ13278 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RIGQ13278 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RIGQ13278 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RIGQ13278 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RIGQ13278 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RIGQ13278 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIGQ13278 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIGQ13278 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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