Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NR1H3Q13133 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR1H3Q13133 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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