Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1BQ13112 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
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