Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK3Q13003 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK3Q13003 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms