Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRJQ12913 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRJQ12913 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
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