Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GRIN2AQ12879 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GRIN2AQ12879 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GRIN2AQ12879 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
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