Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BPTFQ12830 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BPTFQ12830 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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