Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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