Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUP160Q12769 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NUP160Q12769 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms