Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms