Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTDSPL2Q05D32 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms