Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCZQ05513 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCZQ05513 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.5 ms