Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN1Q04323 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms