Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ERCC6Q03468 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ERCC6Q03468 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ERCC6Q03468 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms