Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPEQ02224 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms