Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXOSC10Q01780 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms