Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFITM3Q01628 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms