Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BEX3Q00994 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms