Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms