Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSG6Q00889 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms