Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms