Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2BQ00403 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms