Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2C1P98194 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms