Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRB1P82279 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRB1P82279 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRB1P82279 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRB1P82279 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRB1P82279 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRB1P82279 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRB1P82279 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRB1P82279 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRB1P82279 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRB1P82279 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRB1P82279 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRB1P82279 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CRB1P82279 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CRB1P82279 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CRB1P82279 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRB1P82279 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CRB1P82279 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRB1P82279 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CRB1P82279 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CRB1P82279 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRB1P82279 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CRB1P82279 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRB1P82279 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRB1P82279 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRB1P82279 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRB1P82279 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRB1P82279 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRB1P82279 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRB1P82279 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRB1P82279 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRB1P82279 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CRB1P82279 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRB1P82279 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRB1P82279 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRB1P82279 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRB1P82279 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRB1P82279 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRB1P82279 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRB1P82279 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRB1P82279 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRB1P82279 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRB1P82279 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRB1P82279 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CRB1P82279 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRB1P82279 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRB1P82279 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CRB1P82279 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRB1P82279 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRB1P82279 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRB1P82279 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRB1P82279 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRB1P82279 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRB1P82279 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRB1P82279 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRB1P82279 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRB1P82279 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRB1P82279 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRB1P82279 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRB1P82279 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRB1P82279 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRB1P82279 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRB1P82279 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRB1P82279 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRB1P82279 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRB1P82279 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB1P82279 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRB1P82279 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRB1P82279 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRB1P82279 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRB1P82279 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CRB1P82279 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRB1P82279 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRB1P82279 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRB1P82279 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRB1P82279 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRB1P82279 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms