Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT85P78386 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT85P78386 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT85P78386 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT85P78386 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT85P78386 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT85P78386 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms