Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASIC1P78348 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms