Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX1P78337 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX1P78337 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX1P78337 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX1P78337 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX1P78337 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX1P78337 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX1P78337 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX1P78337 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX1P78337 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITX1P78337 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITX1P78337 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITX1P78337 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX1P78337 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX1P78337 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX1P78337 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX1P78337 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX1P78337 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX1P78337 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX1P78337 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX1P78337 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX1P78337 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX1P78337 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX1P78337 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX1P78337 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX1P78337 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX1P78337 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITX1P78337 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX1P78337 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX1P78337 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX1P78337 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX1P78337 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX1P78337 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX1P78337 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX1P78337 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX1P78337 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX1P78337 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX1P78337 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX1P78337 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITX1P78337 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PITX1P78337 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PITX1P78337 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PITX1P78337 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PITX1P78337 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PITX1P78337 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PITX1P78337 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PITX1P78337 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PITX1P78337 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITX1P78337 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms