Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBA52P62987 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
UBA52P62987 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBA52P62987 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBA52P62987 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms