Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
NLRP6P59044 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NLRP6P59044 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRP6P59044 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms