Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB3P54284 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB3P54284 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms