Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms