Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP11P51784 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP11P51784 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP11P51784 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP11P51784 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP11P51784 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP11P51784 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP11P51784 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP11P51784 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP11P51784 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP11P51784 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP11P51784 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP11P51784 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP11P51784 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP11P51784 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP11P51784 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP11P51784 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP11P51784 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP11P51784 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP11P51784 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP11P51784 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP11P51784 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP11P51784 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP11P51784 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP11P51784 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP11P51784 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP11P51784 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP11P51784 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP11P51784 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP11P51784 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP11P51784 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP11P51784 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP11P51784 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP11P51784 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP11P51784 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP11P51784 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP11P51784 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP11P51784 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP11P51784 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP11P51784 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP11P51784 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP11P51784 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP11P51784 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP11P51784 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP11P51784 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP11P51784 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP11P51784 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP11P51784 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP11P51784 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP11P51784 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP11P51784 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP11P51784 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP11P51784 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP11P51784 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP11P51784 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP11P51784 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP11P51784 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP11P51784 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP11P51784 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms