Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCR4P51679 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCR4P51679 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCR4P51679 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR4P51679 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR4P51679 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR4P51679 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR4P51679 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR4P51679 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR4P51679 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR4P51679 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR4P51679 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR4P51679 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR4P51679 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR4P51679 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCR4P51679 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCR4P51679 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCR4P51679 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCR4P51679 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCR4P51679 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCR4P51679 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCR4P51679 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR4P51679 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR4P51679 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR4P51679 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms