Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCLMP48507 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLMP48507 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLMP48507 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLMP48507 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLMP48507 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLMP48507 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLMP48507 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLMP48507 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLMP48507 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLMP48507 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLMP48507 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLMP48507 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLMP48507 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLMP48507 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCLMP48507 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GCLMP48507 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GCLMP48507 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCLMP48507 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCLMP48507 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCLMP48507 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms