Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCCP43146 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCCP43146 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DCCP43146 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCCP43146 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCCP43146 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCCP43146 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCCP43146 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCCP43146 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCCP43146 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCCP43146 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCCP43146 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCCP43146 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCCP43146 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCCP43146 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCCP43146 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCCP43146 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCCP43146 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCCP43146 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCCP43146 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCCP43146 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCCP43146 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCCP43146 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCCP43146 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DCCP43146 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCCP43146 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCCP43146 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCCP43146 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCCP43146 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCCP43146 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCCP43146 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCCP43146 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCCP43146 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCCP43146 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCCP43146 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCCP43146 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCCP43146 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCCP43146 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCCP43146 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DCCP43146 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCCP43146 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCCP43146 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCCP43146 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCCP43146 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DCCP43146 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCCP43146 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCCP43146 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCCP43146 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCCP43146 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCCP43146 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCCP43146 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCCP43146 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCCP43146 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCCP43146 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DCCP43146 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCCP43146 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCCP43146 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCCP43146 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCCP43146 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCCP43146 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCCP43146 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCCP43146 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCCP43146 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCCP43146 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCCP43146 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCCP43146 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCCP43146 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCCP43146 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCCP43146 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCCP43146 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCCP43146 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCCP43146 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCCP43146 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCCP43146 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCCP43146 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCCP43146 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCCP43146 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCCP43146 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCCP43146 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCCP43146 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCCP43146 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCCP43146 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCCP43146 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCCP43146 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCCP43146 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCCP43146 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCCP43146 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCCP43146 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCCP43146 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCCP43146 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms