Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL35P42766 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL35P42766 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL35P42766 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL35P42766 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms