Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOBEC1P41238 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms