Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPHP41219 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPHP41219 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPHP41219 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPHP41219 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPHP41219 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPHP41219 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPHP41219 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPHP41219 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPHP41219 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPHP41219 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms